MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015574	AAT	2	6	119	124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986243
2	NC_015574	CTG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986243
3	NC_015574	CAG	2	6	181	186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986243
4	NC_015574	CCA	2	6	193	198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986243
5	NC_015574	AGA	2	6	204	209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986243
6	NC_015574	CAA	2	6	244	249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986243
7	NC_015574	AGA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986243
8	NC_015574	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986243
9	NC_015574	AAC	2	6	746	751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986243
10	NC_015574	GAG	2	6	816	821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986243
11	NC_015574	ATC	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986243
12	NC_015574	GGA	2	6	881	886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986243
13	NC_015574	AGAA	2	8	902	909	75 %	0 %	25 %	0 %	333986244
14	NC_015574	GCA	2	6	980	985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986244
15	NC_015574	A	6	6	985	990	100 %	0 %	0 %	0 %	333986244
16	NC_015574	GAA	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986244
17	NC_015574	GAA	2	6	1019	1024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986244
18	NC_015574	CAAA	2	8	1034	1041	75 %	0 %	0 %	25 %	333986244
19	NC_015574	CAAA	2	8	1049	1056	75 %	0 %	0 %	25 %	333986244
20	NC_015574	A	6	6	1061	1066	100 %	0 %	0 %	0 %	333986244
21	NC_015574	A	6	6	1080	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	333986244
22	NC_015574	ATG	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986244
23	NC_015574	TGA	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986244
24	NC_015574	A	6	6	1267	1272	100 %	0 %	0 %	0 %	333986244
25	NC_015574	TAAG	2	8	1293	1300	50 %	25 %	25 %	0 %	333986244
26	NC_015574	ATTAT	2	10	1381	1390	40 %	60 %	0 %	0 %	333986244
27	NC_015574	ACA	3	9	1670	1678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986245
28	NC_015574	ACTA	2	8	1732	1739	50 %	25 %	0 %	25 %	333986245
29	NC_015574	GCA	2	6	1796	1801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986245
30	NC_015574	GCA	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986245
31	NC_015574	TCA	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986245
32	NC_015574	CAT	3	9	1878	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986245
33	NC_015574	TCA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986245
34	NC_015574	T	6	6	2150	2155	0 %	100 %	0 %	0 %	333986245
35	NC_015574	ATG	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986245
36	NC_015574	TGG	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986245
37	NC_015574	TCA	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986245
38	NC_015574	CCA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986245
39	NC_015574	ATG	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986245
40	NC_015574	TTG	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986245
41	NC_015574	AGAT	2	8	2472	2479	50 %	25 %	25 %	0 %	333986245
42	NC_015574	TTC	2	6	2485	2490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986245
43	NC_015574	GA	3	6	2493	2498	50 %	0 %	50 %	0 %	333986245
44	NC_015574	TGTT	2	8	2519	2526	0 %	75 %	25 %	0 %	333986245
45	NC_015574	TTG	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986245
46	NC_015574	CTT	2	6	2716	2721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986245
47	NC_015574	GAT	2	6	2937	2942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986246
48	NC_015574	CAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986246
49	NC_015574	T	6	6	2996	3001	0 %	100 %	0 %	0 %	333986246
50	NC_015574	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986246
51	NC_015574	TGG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986246
52	NC_015574	A	6	6	3128	3133	100 %	0 %	0 %	0 %	333986246
53	NC_015574	TAA	2	6	3207	3212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986246
54	NC_015574	CAGA	2	8	3313	3320	50 %	0 %	25 %	25 %	333986246
55	NC_015574	ACA	3	9	3371	3379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986246
56	NC_015574	CAT	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986246
57	NC_015574	AAG	2	6	3428	3433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986246
58	NC_015574	A	6	6	3497	3502	100 %	0 %	0 %	0 %	333986247
59	NC_015574	TCAT	2	8	3520	3527	25 %	50 %	0 %	25 %	333986247
60	NC_015574	GCT	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986247
61	NC_015574	AGC	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986247
62	NC_015574	TTC	2	6	3591	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986247
63	NC_015574	ACT	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986247
64	NC_015574	AAT	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986247
65	NC_015574	A	6	6	3842	3847	100 %	0 %	0 %	0 %	333986247
66	NC_015574	GGATGT	2	12	3867	3878	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333986247
67	NC_015574	TCAAG	2	10	4006	4015	40 %	20 %	20 %	20 %	333986247
68	NC_015574	C	6	6	4035	4040	0 %	0 %	0 %	100 %	333986247
69	NC_015574	A	6	6	4208	4213	100 %	0 %	0 %	0 %	333986247
70	NC_015574	CT	3	6	4233	4238	0 %	50 %	0 %	50 %	333986247
71	NC_015574	ATT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986247
72	NC_015574	GTTC	2	8	4293	4300	0 %	50 %	25 %	25 %	333986247
73	NC_015574	TAT	2	6	4305	4310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986247
74	NC_015574	CTG	2	6	4318	4323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986247
75	NC_015574	GAT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986247
76	NC_015574	AAAT	2	8	4521	4528	75 %	25 %	0 %	0 %	333986247
77	NC_015574	A	6	6	4573	4578	100 %	0 %	0 %	0 %	333986247
78	NC_015574	GATG	2	8	4635	4642	25 %	25 %	50 %	0 %	333986247
79	NC_015574	AAG	2	6	4771	4776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986247
80	NC_015574	GA	3	6	4793	4798	50 %	0 %	50 %	0 %	333986247
81	NC_015574	A	6	6	4802	4807	100 %	0 %	0 %	0 %	333986247
82	NC_015574	GAAA	2	8	4813	4820	75 %	0 %	25 %	0 %	333986247
83	NC_015574	AT	3	6	4840	4845	50 %	50 %	0 %	0 %	333986247
84	NC_015574	CATT	2	8	4868	4875	25 %	50 %	0 %	25 %	333986247
85	NC_015574	TCCCT	2	10	4900	4909	0 %	40 %	0 %	60 %	333986247
86	NC_015574	GAA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986247
87	NC_015574	GGA	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986247
88	NC_015574	AAG	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986247
89	NC_015574	AGA	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986247
90	NC_015574	AAC	2	6	5197	5202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986247
91	NC_015574	ATT	2	6	5216	5221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986247
92	NC_015574	GCC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333986247
93	NC_015574	GGA	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986247
94	NC_015574	GGA	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986247
95	NC_015574	TCTAAA	2	12	5354	5365	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333986247
96	NC_015574	AGT	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986248
97	NC_015574	CAGGAA	2	12	5555	5566	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333986248
98	NC_015574	GGTA	2	8	5571	5578	25 %	25 %	50 %	0 %	333986248
99	NC_015574	AAC	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986248
100	NC_015574	AAT	2	6	5598	5603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986248
101	NC_015574	AAT	2	6	5617	5622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986248
102	NC_015574	AGGT	2	8	5642	5649	25 %	25 %	50 %	0 %	333986248
103	NC_015574	AG	3	6	5753	5758	50 %	0 %	50 %	0 %	333986248
104	NC_015574	TGC	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986248
105	NC_015574	AAG	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986248
106	NC_015574	TCC	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986248
107	NC_015574	GAAG	2	8	6235	6242	50 %	0 %	50 %	0 %	333986248
108	NC_015574	TAC	2	6	6316	6321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986248
109	NC_015574	CAA	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986248
110	NC_015574	GGA	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986248
111	NC_015574	ACA	2	6	6653	6658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986248
112	NC_015574	TGCA	2	8	6836	6843	25 %	25 %	25 %	25 %	333986248
113	NC_015574	GCA	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986248
114	NC_015574	GCA	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986248
115	NC_015574	AAT	2	6	7073	7078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986249
116	NC_015574	ATC	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986249
117	NC_015574	CATAG	2	10	7161	7170	40 %	20 %	20 %	20 %	333986249
118	NC_015574	AGGGC	2	10	7181	7190	20 %	0 %	60 %	20 %	333986249
119	NC_015574	AGC	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986249
120	NC_015574	CAT	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986249
121	NC_015574	A	7	7	7451	7457	100 %	0 %	0 %	0 %	333986249
122	NC_015574	GGA	2	6	7485	7490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986249
123	NC_015574	TGA	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986249
124	NC_015574	TGG	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986249
125	NC_015574	GCT	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986249
126	NC_015574	GCA	2	6	7856	7861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986249
127	NC_015574	TGGC	2	8	7959	7966	0 %	25 %	50 %	25 %	333986249
128	NC_015574	GGT	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986249
129	NC_015574	TGT	2	6	7994	7999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986249
130	NC_015574	AAC	2	6	8010	8015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986249
131	NC_015574	AAG	2	6	8058	8063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986249
132	NC_015574	TTA	2	6	8356	8361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986250
133	NC_015574	TGA	2	6	8405	8410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986250
134	NC_015574	AGA	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986250
135	NC_015574	GAA	2	6	8481	8486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986250
136	NC_015574	GCT	2	6	8514	8519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986250
137	NC_015574	TCA	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986250
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140	NC_015574	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986250
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143	NC_015574	AAG	2	6	8702	8707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986250
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145	NC_015574	CAT	2	6	8734	8739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986250
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244	NC_015574	AAGAT	2	10	14647	14656	60 %	20 %	20 %	0 %	333986254
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254	NC_015574	TGG	2	6	15240	15245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986255
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256	NC_015574	T	7	7	15418	15424	0 %	100 %	0 %	0 %	333986255
257	NC_015574	TCA	2	6	15430	15435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986256
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261	NC_015574	GGC	2	6	15811	15816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986257
262	NC_015574	TAT	2	6	15955	15960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986257
263	NC_015574	ATT	2	6	16070	16075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986257
264	NC_015574	AAT	2	6	16078	16083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986257
265	NC_015574	TGT	2	6	16119	16124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986257
266	NC_015574	CAA	2	6	16137	16142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986257
267	NC_015574	T	6	6	16175	16180	0 %	100 %	0 %	0 %	333986257
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269	NC_015574	CAA	2	6	16278	16283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986257
270	NC_015574	AT	3	6	16316	16321	50 %	50 %	0 %	0 %	333986257
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273	NC_015574	T	6	6	16799	16804	0 %	100 %	0 %	0 %	333986258
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281	NC_015574	CTT	2	6	17134	17139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986258
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290	NC_015574	CTG	2	6	18076	18081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986259
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383	NC_015574	A	6	6	23788	23793	100 %	0 %	0 %	0 %	333986264
384	NC_015574	A	6	6	23883	23888	100 %	0 %	0 %	0 %	333986264
385	NC_015574	CTCAAC	2	12	23993	24004	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333986264
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388	NC_015574	CAG	2	6	24195	24200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986264
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394	NC_015574	TAA	2	6	24522	24527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986264
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